随着我国社会经济的不断发展，民办非企业单位（以下简称“民非单位”）在教育、医疗、科技、文化等领域发挥着越来越重要的作用。作为非营利性质的社会组织，民非单位在运行过程中，其举办者的权益保障问题日益受到关注。然而，由于现行法律体系对民非单位的界定和管理尚不完善，举办者在实际操作中常常面临权益难以有效保障的困境。

首先，民非单位的法律地位较为模糊。根据《民办非企业单位登记管理暂行办法》，民非单位属于“企业、事业单位、社会团体和其他社会力量”设立的，从事非营利性社会服务活动的组织。尽管如此，其在法律上的权利义务关系仍不够明确，特别是在举办者与机构之间的权责划分上存在较大争议。部分民非单位在注册时并未明确举办者的具体权利范围，导致在运营过程中出现纠纷时缺乏有效的法律依据。

其次，举办者的财产权益缺乏制度保障。民非单位的资金来源主要包括出资人投入、社会捐赠以及政府资助等。但由于其非营利性质，举办者通常无法直接从机构中获取经济回报。这种模式虽然有助于确保资源用于公益目的，但也使得举办者在资金使用、资产处置等方面缺乏话语权。一旦机构出现经营困难或需要进行结构调整，举办者的合法权益往往难以得到充分保护。

再者，举办者在决策和管理中的参与度较低。许多民非单位在内部治理结构上较为松散，缺乏健全的法人治理机制。一些机构的理事会或董事会成员多由政府相关部门人员担任，而真正具有出资背景的举办者则被边缘化。这种现象不仅影响了举办者的积极性，也容易造成机构运作效率低下，甚至引发内部矛盾。

此外，民非单位在变更、终止等关键环节中，举办者的权益也常被忽视。例如，在机构合并、分立或解散过程中，如何合理分配资产、处理债务、保障员工权益等问题，往往缺乏明确的法律规定。如果缺乏完善的制度设计，举办者可能在这些过程中处于被动地位，甚至面临财产损失的风险。

为解决上述问题，有必要从以下几个方面着手改进：

一是完善相关法律法规，明确民非单位的法律地位及举办者的权利义务。可以通过修订《民办非企业单位登记管理暂行办法》或其他相关法规，进一步细化举办者的权益范围，增强法律的可操作性和权威性。

二是建立科学合理的治理结构，保障举办者在机构决策中的合法参与。鼓励民非单位设立独立的理事会或监事会，并确保举办者在其中拥有相应的发言权和表决权。

三是加强对民非单位财务监管，确保资金使用的透明与规范。通过引入第三方审计、信息公开等机制，提高财务管理的透明度，防止资产流失或滥用。

四是建立健全的退出机制，保障举办者在机构变更、终止过程中的合法权益。制定详细的资产清算和分配程序，确保在机构终止时，举办者的贡献能够得到合理体现。

综上所述，民办非企业单位举办者权益的保障问题涉及法律、制度、治理等多个层面。只有通过不断完善相关制度，提升治理水平，才能真正实现民非单位的可持续发展，同时维护举办者的合法权益。